R语言之xlsx包读写Excel数据的操作

这篇文章主要介绍了R语言之xlsx包读写Excel数据的操作,具有很好的参考价值,希望对大家有所帮助。一起跟随小编过来看看吧

感谢Adrian A. Drǎgulescu发布的xlsx包

xlsx包提供了必要的工具来与Excel 2007进行交互。用户可以阅读和编写xlsx,并可以通过设置数据格式、字体、颜色和边框来控制电子表格的外观。设置打印区域,缩放控制,创建分割和冻结面板,添加页眉和页脚。包使用Apache POI项目中的java库。本篇主要分享利用xlsx工具包在读写xlsx过程中所碰到的问题及解决办法。

工具准备

强烈建议大家使用RStudio这个IDE,它是以今为止对R语言最友好的一个IDE之一,而且使用很方便。特别是在新包下载安装的时候,只需请求要安装的包名,RStudio会自动将关联的其他包也一并下载并安装。

安装R、安装RStudio;

一个简单的示例数据(本次以iris鸢尾花数据为例);

下载安装xlsx(Rstudio会同步下载并安装rJava, xlsxjars两个包);

 > # 下载并安装xlsx包 > install.packages("xlsx") > library(xlsx)

【基础】简单读取excel文件数据

假如是csv或txt等文本类的数据文件,利用R内置函数read.csv()与read.table()就可读取(注意编码格式的参数设置)。Excel由于使用范围最广,很多问题不可避免,因此,xlsx包提供了专门读取xlsx的函数read.xlsx和read.xlsx2,为什么有两个呢?请看以下区别:

函数参数
xlsx::read.xlsx()file, sheetIndex, sheetName=NULL, rowIndex=NULL,startRow=NULL,endRow=NULL, colIndex=NULL,as.data.frame=TRUE, header=TRUE, colClasses=NA,keepFormulas=FALSE, encoding=“unknown”, password=NULL, …
xlsx::read.xlsx2()file, sheetIndex, sheetName=NULL, startRow=1,colIndex=NULL, endRow=NULL, as.data.frame=TRUE, header=TRUE,colClasses=“character”, password=NULL, …

其实只是细微的差别,大家自己体会即可。下面给个参考案例:

 > # 指定file和sheetIndex(或sheetName),即可定位到相应的工作表 > data1 <- read.xlsx("iris.xlsx",sheetIndex = 1) > head(data1)
Sepal.LengthSepal.WidthPetal.LengthPetal.WidthSpecies
5.13.51.40.2setosa
4.93.01.40.2setosa
4.73.21.30.2setosa
4.63.11.50.2setosa
5.03.61.40.2setosa
5.43.91.70.4setosa

【基础】简单写入数据到excel文件

切莫用R内置函数read.csv()与read.table()去生成xlsx文件,会有你意想不到的麻烦,还是采用专业的包来解决问题吧。 xlsx包同样提供了两个写入数据的函数write.xlsx()和write.xlsx2(),其中细微区别自行参透(注意参数 ...)。

函数参数
xlsx::write.xlsx()x, file, sheetName=“Sheet1”, col.names=TRUE, row.names=TRUE, append=FALSE, showNA=TRUE, password=NULL
xlsx::write.xlsx2()x, file, sheetName=“Sheet1”,col.names=TRUE, row.names=TRUE, append=FALSE, password=NULL, ...

下面是参考案例:

 ># 指定x待写入数据,file生成的文件名,row.names为false则不生成行名,指定sheet工作表名为Sheet1 >write.xlsx(iris, file = "iris.xlsx", row.names = FALSE, sheetName = "Sheet1")

想必会有人在这里踩坑,大家应该注意到有一个append的参数,是否认为将其值设置为TRUE的话,就可以多次向表中写入数据?那就真踩坑了。查看xlsx包中的注释也很模糊:

 > # a logical value indicating if x should be appended to an existing file. > # 翻译:一个逻辑值,指示是否应该将x附加到现有文件中

附加到现有文件中,实际上是增加新的sheet,而非在原有sheet工作表中继续增加数据。如需在同一个sheet工作表中多次增加数据,请继续往下看。

【进阶】随心所欲读取excel中的各种信息

说随心所欲 一点不夸张,不仅可以取出excel中的数据,还能识别excel单元格的样式(包括颜色、字体、大小、标注、数据类型等等)。其原理与数据库有点相似,先是定义一个工作簿的对象,再基于工作簿定义里面的工作表,进而逐级查询。下面进行详细介绍:

【样例数据】文件名:iris10.xlsx。

声明一个工作簿对象

 > # loadWorkbook(file, password=NULL)  #用于声明一个工作簿对象 > # 提醒:如果excel文件不在工作空间内,file最好指定为绝对路径 > wb <- createWorkbook("iris10.xlsx")

检索工作簿中的sheet

 > # sheets <- getSheets(wb)  #用于生成一个list对象,其中包含所有工作表的信息,数据类型为rJava::jobjRef,在此不深入讲解 > sheets <- getSheets(wb)

定位目标sheet

 > # 本例只有一个sheet,名称为“Sheet1” > sheet <- sheets[["Sheet1"]]  # sheet的数据类型为rJava::jobjRef

读取数据【方法一】

上面read.xlsx()方法能够将整个sheet工作表的数据读取出来,在这里提供另一种方法,不过相对麻烦一点,使用的是xlsx::readColumns()函数

函数参数
xlsx::readColumns()sheet,startColumn,endColumn,startRow,endRow=NULL,as.data.frame=TRUE,header=TRUE, colClasses=NA, …
xlsx::readRows()sheet, startRow, endRow, startColumn, endColumn=NULL

xlsx::readRows()使用起来比较麻烦,不如xlsx::readColumns()好用,有兴趣的可自行研究一下。另外还有两个函数,用于定位表内数据第一行和最后一行的索引(这里与Java的性质一致,从0开始算起)

函数参数
getFirstRowNum()无参。该函数必须基于sheet对象
getLastRowNum()无参。该函数必须基于sheet对象

xlsx::readRows()使用起来比较麻烦,不如xlsx::readColumns()好用,有兴趣的可自行研究一下。另外还有两个函数,用于定位表内数据第一行和最后一行的索引(这里与Java的性质一致,从0开始算起)

函数参数
getFirstRowNum()无参。该函数必须基于sheet对象
getLastRowNum()无参。该函数必须基于sheet对象

下面以xlsx::readColumns()为例获取数据:

 > # 该函数必须提供数据的起始列索引值、终止列索引值、起始行索引值、终止行索引值; > dataTmp <- readColumns(sheet, startColumn = 1, endColumn = 10, startRow = sheet$getFirstRowNum()+1, endRow = sheet$getLastRowNum()+1, header = T, as.data.frame=TRUE)

as.data.frame=TRUE决定了输出结果为一个数据框。

缺点:在不清楚数据结构的情况下,首行和末行索引值可以求得,但列数一般难以确定,可能导致列缺失或生成多余的列

读取数据【方法二】

另一种方法相对【方法一】要好一点,先是将所有单元格的值获取出来,再生成数据框。(稍微复杂一点)

函数参数注释
xlsx::getRows()sheet, rowIndex=NULL用于获取sheet的每一行数据,返回值list,数据类型为rJava::jobjRef
xlsx::getCells()row, colIndex=NULL, simplify=TRUE用于获取行内每个单元格的数据,返回值list,数据类型为rJava::jobjRef
xlsx::getCellValue()cell, keepFormulas=FALSE, encoding=“unknown”用于获取所有单元格的值,返回值list,数据类型为character,长度为数据表m*n

注意:这里连同标题行也作为单元格数据一并获取,并且如果有null值的单元格,会跳过该单元格

 > # 获取cells进而获取values > cells <- sheet %>% getRows() %>% getCells() > values <- lapply(cells,getCellValue)

values获取出来就如下面这个样子,你会发现value的名称向量,每个值都包含了所在单元格的x、y坐标值。

 > names(values)  #查看values的名称向量 [1] "1.1" "1.2" "1.3" "1.4" "1.5" "2.1" "2.2" "2.3" "2.4" "2.5" "3.1" "3.2" "3.3" "3.4" "3.5" "4.1" [17] "4.2" "4.3" "4.4" "4.5" "5.1" "5.2" "5.3" "5.4" "5.5" "6.1" "6.2" "6.3" "6.4" "6.5" "7.1" "7.2" [33] "7.3" "7.4" "7.5" "8.1" "8.2" "8.3" "8.4" "8.5" "9.1" "9.2" "9.3" "9.4" "9.5" "10.1" "10.2" "10.3" [49] "10.4" "10.5" "11.1" "11.2" "11.3" "11.4" "11.5"

将这些坐标值拆分出来,作为等会重排数据的索引

 > addresses <- sapply(names(values),FUN = function(x) str_split(string = x,pattern = "[.]"))

接下来就只需要将其进行重排,形成数据框即可。

 > datas.name <- vector(mode = "character")  #声明一个空的向量,用来存放标题 > datas <- data.frame()  # 声明一个空的数据框,用来存放目标数据 > # 用sapply代替for做循环,避免占用大量内存。同时注意sapply使用时的环境问题,用.GlobalEnv指向最外层环境的变量。 > # 这里只对数据进行重排,无需进行计算,所以invisible不显示计算结果 > invisible(sapply(addresses,FUN = function(x) { +  if (x[1] == "1") { +   .GlobalEnv$datas.name = c(.GlobalEnv$datas.name,.GlobalEnv$values[[1]]) +   .GlobalEnv$values[[1]] <- NULL +  } else { +   .GlobalEnv$datas[x[1],x[2]] <- .GlobalEnv$values[[1]] +   .GlobalEnv$values[[1]] <- NULL +  } + })) > names(datas) <- datas.name  #最后在添加标题 > View(datas)

得到结果与原excel数据一致

获取单元格样式与获取数据的方式一致,这里不再增加过多篇幅讲解,只做简单介绍。以下函数按函数名字面理解。

函数参数
xlsx::CellStyle()wb, dataFormat=NULL, alignment=NULL,border=NULL, fill=NULL, font=NULL, cellProtection=NULL
xlsx::setCellStyle()cell, cellStyle
xlsx::getCellStyle()cell
xlsx::createCellComment()cell, string="", author=NULL, visible=TRUE
getCellComment()cell
removeCellComment()cell

其他函数后续如有机会,再做详细介绍吧。

【进阶】随心所欲将数据写入excel文件

我想大家更想看到的就是这部分内容了。确实在日常处理数据时,将数据存储到excel中进行传递是常有的事,谁叫excel是微软亲生的呢。闲话少说,直入正题。

前面基础篇通过write.xlsx()函数将数据写入excel文件中,同时指定sheet名称。但这种写入是一次性的,即一次写入多少就多少。在工作簿里面新增sheet工作表用append控制,但在同个sheet上继续写入数据,会报错:

 > write.xlsx(datas,file = "iris10.xlsx",sheetName = "Sheet1",row.names = F,append = T) Error in .jcall(wb, "Lorg/apache/poi/ss/usermodel/Sheet;", "createSheet", : java.lang.IllegalArgumentException: The workbook already contains a sheet of this name

说是这个名称的sheet已经存在同名的了!

这次我们采用高级一点的方法,跟前面进阶读取数据一样,先是定义一个工作簿的对象,再创建或加载sheet工作表。

函数参数注释
xlsx::createWorkbook()type=“xlsx”用于生成一个新的excel工作簿
xlsx::loadWorkbook()file, password=NULL用于加载当前已存在的excel工作簿
xlsx::saveWorkbook()wb, file, password=NULL使用完必须保存工作簿
xlsx::createSheet()wb, sheetName=“Sheet1”用于生成一个新的sheet工作表
xlsx::removeSheet()wb, sheetName=“Sheet1”用于删除工作表
xlsx::getSheets()wb用于获取当前工作簿里的工作表清单,返回值是list
xlsx::addDataFrame()x, sheet, col.names=TRUE, row.names=TRUE,startRow=1,用于获取当前工作簿里的工作表清单,返回值是list
(续上)startColumn=1,colStyle=NULL, colnamesStyle=NULL,rownamesStyle=NULL, showNA=FALSE, characterNA="", byrow=FALSE

前面讲过如何加载已有工作簿,这里以生成新excel工作簿为例,将数据写入文件中

 > wb <- xlsx::createWorkbook() > sheets <- getSheet() # 新生成的工作簿没有sheet,系统提示:Workbook has no sheets! > sheet <- createSheet(wb,sheetName = "newSheet1")

此时R内存中已经生成了一个工作簿,包含一个空的sheet工作表,通过addDataFrame()函数将数据写入sheet中.

 > # 用上面生成的datas数据框对象,取前4行数据写入当前sheet对象中 > addDataFrame(data[1:4,],sheet,row.names = F) > saveWorkbook(wb,file = "iris_new.xlsx")

==记得保存工作簿、记得保存工作簿、记得保存工作簿==

如果是在已有excel工作簿上操作,这里最好做一个判断,避免覆盖现有数据,造成不必要的麻烦。如果当前sheet的最后一行索引不等于零(说明有数据),则将新数据写到最后一行数据的下一行,同时不加入列名行(col.names = FALSE);如果为零则将数据直接添加到sheet中。

 > # 用上面生成的datas数据框对象,取前4行数据写入当前sheet对象中 > if (sheet$getLastRowNum() != 0) { +     addDataFrame(data[1:4,],sheet,row.names = F,col.names = F,startRow = sheet$getLastRowNum() + 2) +    } else { +     addDataFrame(data[1:4,],sheet,row.names = F) +    } + } > saveWorkbook(wb,file = "iris_new.xlsx")

至此,你应该知道如何在原有工作表基础上新增数据行了吧?多么方便!!

如果要增加新的sheet工作表,只需将sheet重新定义一个新的sheetName即可。

以上就是R语言之xlsx包读写Excel数据的操作的详细内容,更多请关注0133技术站其它相关文章!

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